Pokročilé techniky pro vizualizaci a kvantifikaci 3D dat

Základní informace

Kurz je zaměřen na základy zpracování volumetrických a časosběrných mikroskopických dat. Cílem je představení několika nástrojů pro zpracování, vizualizaci a kvantitativní analýzu 3D a 4D mikroskopických dat.

První část kurzu je zaměřena na představení softwaru Imaris. V druhé části bude představeno dalších několik nástrojů.

Předchozí znalost softwaru není vyžadována.

Datum: 19.-20.6.2024
Délka kurzu: 2 dny
Jazyk kurzu: angličtina
Požadavky: vlastní laptop

Kurz je organizován hybridní formou a je tak možné se zúčastnit buď osobně, nebo online. Program bude stejný pro obě skupiny.

Program

Přednášející: Štěpán Kortus, Barbora Hyklová, Iva Švecová
Místnost: Tyrkysová posluchárna/online

Den 1, Středa 19.6.
Dopolední blok: 9:00-11:30
9:00-9:10 Registrace
9:10-9:30 Možnosti zpracování obrazu v rámci ÚEM
9:30-10:15 Představení Imaris prostředí
10:15-10:30 Přestávka
10:30-11:30 Přehled Imaris modulů
Přestávka na oběd: 11:30-12:30
Odpolední blok: 12:30-15:30
12:30-13:55 Imaris moduly
13:55-14:15 Přestávka
14:15-15:30 Kvantitativní analýza v Imaris
Den 2, Čtvrtek 20.6.
Dopolední blok: 9:00-11:30
9:00-10:15 Hromadné zpracování dat a další pokročilé funkce v Imaris
10:15-10:30 Přestávka
10:30-11:30 Sešívání obrazu a Imaris Stitcher
Přestávka na oběd: 11:30-12:30
Odpolední blok: 12:30-15:00
12:30-13:55 Freeware možnosti pro zpracování 3D dat
13:55-14:15 Přestávka
14:15-15:00 Úvod do softwaru Irbis

Registrace

Registrační poplatek: zdarma
Deadline pro registraci: 13.6.