Zpět

Pokročilé techniky pro vizualizaci a kvantifikaci 3D dat

Základní informace

Kurz je zaměřen na základy zpracování volumetrických a časosběrných mikroskopických dat. Cílem je představení několika nástrojů pro zpracování, vizualizaci a kvantitativní analýzu 3D a 4D mikroskopických dat.

První část kurzu je zaměřena na představení softwaru Imaris. V druhé části bude představeno dalších několik nástrojů.

Předchozí znalost softwaru není vyžadována.

Datum: 19.–20.6.2024
Délka kurzu: 2 dny
Jazyk kurzu: angličtina
Požadavky: vlastní laptop

Kurz je organizován hybridní formou a je tak možné se zúčastnit buď osobně, nebo online. Program bude stejný pro obě skupiny.

Program

Přednášející: Štěpán Kortus, Barbora Hyklová, Iva Švecová
Místnost: Tyrkysová posluchárna/online

Den 1, Středa 19. 6.

Dopolední blok: 9:00-11:30

9:00–9:10  Registrace
9:10–9:30  Možnosti zpracování obrazu v rámci ÚEM
9:30–10:15  Představení Imaris prostředí
10:15–10:30  Přestávka
10:30–11:30  Přehled Imaris modulů

Přestávka na oběd: 11:30–12:30

Odpolední blok: 12:30–15:30

12:30–13:55  Imaris moduly
13:55–14:15  Přestávka
14:15–15:30  Kvantitativní analýza v Imaris

Den 2, Čtvrtek 20. 6.

Dopolední blok: 9:00–11:30

9:00–10:15  Hromadné zpracování dat a další pokročilé funkce v Imaris
10:15–10:30  Přestávka
10:30–11:30  Sešívání obrazu a Imaris Stitcher

Přestávka na oběd: 11:30–12:30

Odpolední blok: 12:30–15:00

12:30–13:55  Freeware možnosti pro zpracování 3D dat
13:55–14:15  Přestávka
14:15–15:00  Úvod do softwaru Irbis

Registrace

Registrační poplatek: zdarma
Deadline pro registraci: 13. 6.