Biologie genomu

Naše oddělení se věnuje objasňování molekulárních mechanismů, které udržují integritu genomu – základní stav DNA, jenž je klíčový pro zdraví buněk a prevenci onemocnění. Primárním výzkumným cílem je objasnit, jak konflikty mezi replikací a transkripcí DNA (TRCs), spojené s tvorbou R-smyček, způsobují zastavení DNA replikace, replikační stress, a DNA poškození v nádorových i nenádorových buňkách, a jak se buňky proti těmto událostem brání. Snažíme se identifikovat faktory, jejichž vyřazení bude způsobovat náchylnost k TRCs a R-smyčkám, a zjistit, zda lze tyto faktory terapeuticky využít ke zvýšení účinnosti a zmírnění nežádoucích účinků současné protinádorové léčby. K dosažení těchto cílů využíváme 2D a 3D buněčné modely. Kromě běžných technik molekulární biologie využíváme také metody, které nám umožňují měřit dynamiku replikace a poškození DNA, jako je DNA fiber assay a kvantitativní mikroskopie, nebo identifikovat specifické pozice v genomu díky pokročilým technikám sekvenování.