Mikroskopie

Cílem naší skupiny je umožnit uživatelům přístup ke špičkovým přístrojům a sofwaru na následnou analýzu dat, a poskytnout jim podporu ve všech krocích procesu, od návrhu experimentu až po vyhodnocení dat.  

K dispozici jsou následující techniky:  

• Mikroskopie v průchozím světle  
• Fluorescenční mikroskopie v širokém poli  
• Mikroskopie s fázovým kontrastem a DIC 
• Laserová skenovací konfokální mikroskopie (jednokanálová a vícekanálová)  
• Rychlá konfokální mikroskopie se spinning diskem  
• Superrezoluční mikroskopie (Airyscan nebo SpinSR10)  
• Fluorescenční mikroskopie s dvoufotonovou excitací  
• Vysokorychlostní fluorescenční mikroskopie s dvoufotonovou excitací  
• Obnovení fluorescence po fotovybělení (FRAP)  
• Light-sheet mikroskopie  

Součástí naší skupiny je i laboratoř pro pokročilé zobrazování živých zvířat (BSL2) vybavená pokročilým 3D zobrazovacím systémem a kompletním zázemím pro manipulaci s živými vzorky. 

K analýze dat jsou k dispozici počítače vybavené softwarem pro zpracování obrazu. V případě potřeby poskytujeme konzultace a podporu ohledně analýzy dat, a můžeme i vyvinout workflow potřebné pro konkrétní aplikaci.  

Členství ve výzkumných infrastrukturách

Naše skupina je od roku 2022 součástí národní infrastruktury Czech-Bioimaging (otevře se v novém okně) zaměřené na biologické a medicínské zobrazování. Hlavním cílem této infrastruktury je zajištění otevřeného přístupu k pokročilým zobrazovacím technikám. Od roku 2024 jsme také součástí pražského uzlu evropské sítě Euro-Bioimaging (otevře se v novém okně), která poskytuje otevřený přístup ke špičkovým zobrazovacím technologiím v oblasti biologie a medicíny.

Školení a konzultace

Pro nové uživatele poskytujeme základní školení, které je nutné podstoupit před používáním každého z mikroskopů.

K tomu nabízíme i doplňující školení týkající se pokročilého nastavení mikroskopu a metod, které nejsou součástí základního školení.

Mezi tyto metody mimo jiné patří: superrozlišovací mikroskopie s Airyscan detektorem, FRAP (obnovení fluorescence po fotovybělení), multifotonová mikroskopie, použití inkubace (kontrola CO2 a teploty), či nastavení DIC (diferenciální interferenční kontrast).

Dále poskytujeme odborné konzultace ohledně návrhu experimentu.

Pomoc s analýzou obrazu a zpracováním dat

Nabízíme pomoc s výběrem softwaru vhodného pro analýzu konkrétních dat a zodpovězení příslušných výzkumných otázek. Pokud je třeba, můžeme také napřímo asistovat u provedení analýzy a vyhodnocení výsledků. Ve speciálních případech jsme také schopni vytvořit workflow potřebné pro konkrétní aplikaci.

Slevy

• Úvodní školení a pilotní experimenty nejsou zpoplatněny.
• Rezervace mimo běžnou pracovní dobu (18:00–8:00) a rezervace o víkendech a státních svátcích jsou zlevněny o 25 %.
• Pokročilé zobrazovací modality jsou zlevněny o 25 % za každou modalitu.

Zlevněné modality:

• Zobrazování v živých systémech (např. buněčné kultury, in vivo zobrazování)
• Super-rezoluční mikroskopie (např. Olympus super-resolution, Airyscan)
• Fotomanipulace (např. FRAP, fotoaktivace, laserová ablace)

Slevy za modality se sčítají, při vytváření rezervace v Calpendu musí být odpovídající kombinace zvolena z rozbalovacího menu Modality.

Výpočet ceny
Konečná cena za hodinu je v Calpendu vypočítána automaticky podle vzorce:
Konečná cena = základní cena × (1 − počet modalit × sleva za modalitu) × (1 − sleva mimo pracovní dobu)

Při využití servisních služeb Mikroskopie, prosíme uveďte ve svých publikacích následující informace:

V případě níže uvedených přístrojů prosím dále uveďte: