Molekulární biolog Martin Andrš získal prestižní pětiletý grant GAČR JUNIOR STAR na projekt zaměřený na studium R-smyček a replikačního stresu – procesů, které vznikají při konfliktech mezi čtením (transkripcí) a kopírováním (replikací) DNA a které mohou sehrát významnou roli ve vzniku a rozvoji nádorových onemocnění. Zároveň od nového roku zakládá na ÚEM AV ČR nové Oddělení biologie genomu a povede vlastní výzkumnou skupinu.
Jeho výzkum se zaměří na zodpovězení následujících otázek:
- jakou roli má oxidační stres při vzniku konfliktů mezi transkripcí a replikací DNA,
- jak vznikají R-smyčky a proč mohou zastavit replikaci DNA,
- jak buňka reaguje na problém při replikaci DNA,
- a jak tyto procesy ovlivňují chování nádorů, zejména v prostředí hypoxie (nízké hladiny kyslíku).
Výzkum se opírá o nejmodernější metodologie, jako jsou sekvenování DNA nové generace (NGS), multi-omické analýzy a pokročilé mikroskopické techniky.
Proč je to důležité? Lepší porozumění těmto jevům může odhalit nové slabiny nádorových buněk, což by v budoucnu mohlo umožnit vývoj účinnějších a zároveň šetrnějších protinádorových terapií.
Oddělení biologie genomu
Nově vznikající oddělení se zaměří na objasnění molekulárních mechanismů, které zajišťují integritu genomu, tedy stabilitu DNA nezbytnou pro správnou funkci buněk a prevenci onemocnění. Hlavním cílem je pochopit, jak konflikty mezi replikací a transkripcí DNA a vznik R-smyček vedou k problémům při replikaci DNA a jejímu poškození, a jak se nádorové i nenádorové buňky těmto událostem brání. Výzkumný tým bude využívat 2D i 3D buněčné modely a širokou paletu metod od klasické molekulární biologie až po specializované techniky, které umožní měřit dynamiku replikace a DNA poškození (např. DNA fiber assay, kvantitativní mikroskopie aj.).
