Přeskočit na hlavní obsah

Molekulární biologie nádorů

Výzkumné oddělení

Skupinový portrét týmu z Oddělení molekulární biologie nádorů

Oddělení se zabývá výzkumem molekulárních charakteristik nádorových onemocnění, především tlustého střeva a konečníku. Pracujeme na molekulárně-epidemiologické úrovni s cílem identifikovat biologické ukazatele zvýšené predispozice vůči nádorovému onemocnění, včasné diagnostiky, individuální odpovědi na protinádorovou léčbu a dlouhodobé prognózy. V rámci oddělení pracujeme s různými typy biologického materiálu od pacientů s nádorovým onemocněním, jako jsou solidní tkáň, krevní buňky, plazma nebo stolice.

Pavel Vodička

Vedoucí
MUDr. Pavel Vodička, CSc., DSc.

Telefonní číslo +420 241 062 694
Mailová adresa pavel.vodicka@iem.cas.cz
Zobrazit více
Přeskočit navigaci

Pracovníci

Zástupce vedoucího oddělení

Ing. Veronika Vymetálková, Ph.D.

Vědečtí pracovníci

Mgr. Klára Červená, Ph.D.

MUDr. Josef Horák, Ph.D.

Mgr. Michal Kroupa, Ph.D.

RNDr. Alessio Naccarati, Ph.D.

Nazila Navvabi, Ph.D.

RNDr. Soňa Vodenková, Ph.D.

MUDr. Pavel Vodička, CSc., DSc.

MUDr. Ludmila Vodičková, CSc.

Ing. Veronika Vymetálková, Ph.D.

Postgraduální studenti

Safa Andarawi, M.Sc., MMedEd

Mgr. Kateřina Balounová

Saba Selvi, M.Sc.

MUDr. Kateřina Šašková

Na mateřské dovolené

Ing. Anna Šišková

Mgr. Kristýna Tomášová

Pregraduální studenti

Bc. Natálie Danešová

Bc. Petr Dostál

Spolupracovníci

Mgr. Markéta Urbanová, Ph.D.

Techničtí pracovníci

Dominika Dušková

RNDr. Petr Hanák, Ph.D.

Významné výsledky


Mutační analýza genů definujících adenomy tlustého střeva a konečníku a jejich přechod v adenokarcinom

S cílem objasnit genetiku vývoje kolorektálních adenomů v kolorektální karcinom (CRC) jsme stanovovali mutační spektrum v genech CRC (APC, BRAF, EGFR, NRAS, KRAS, PIK3CA, POLE, POLD1, SMAD4, PTEN, TP53) u 96 adenomů a in situ karcinomů pomocí technikou high-throughput genotyping. Nalezli jsme vyšší frekvenci patogenních variant v těchto genech. APC, KRAS a TP53 mutační frekvence byly nižší u adenomů než u karcinomu. Distribuce mutačních frekvencí byla následující: adenomy s nízkým stupněm dysplázie-adenomy s vysokým stupněm dysplázie-karcinom in situ: APC gen 42,9-56,0-54,5 %; KRAS gen 32,7-32,0-45,5 %; TP53 gen 8,2-20,0-18,2 %. KRAS mutace se vyskytovaly hlavně s vilózní histologií, APC promotorová metylace byla spjata s variantami v POLE genu. Potvrdili jsme mnohastupňový postupný model akumulace mutací v uvedených genech.

Distribuce genetických změn detekovaných u adenomů nízkého, vysokého stupně a in situ karcinomů. Každý řádek představuje jednoho pacienta a každý sloupec představuje jeden gen. Různé typy mutací jsou značeny různými barvami. Sloupcový graf nahoře vykazuje celkový počet mutací v daném genu.

 

Publikace:

Jungwirth, J., Urbanová, M., Boot, A., Hošek, P., Bendová, P., Šišková, A., Švec, J., Kment, M., Tůmová, D., Summerová, S., Beneš, Z., Buchler, T., Kohout, P., Hucl, T., Matěj, R., Vodičková, L., van Wezel, T., Vodička, P., Vymetálková, V.: (2022) Mutational analysis of driver genes defines the colorectal adenoma: in situ carcinoma transition. Scientific Reports. 12(1): 2570. doi: 10.1038/s41598-022-06498-9.


Projekty

Poskytovatel

Rok

1. 5. 2019 – 31. 12. 2023

Klinicko-patologické a molekulární faktory detekované v metastázách, které předpovídají odpověď na léčbu karcinomu tlustého střeva.
1. 5. 2021 – 31. 12. 2024

Homeostáza telomér jako potencialni biomarker rizika, prognózy a progrese u gynekologických nádorů.
1. 5. 2021 – 31. 12. 2024

Využití konceptu tekuté biopsie pro charakterizaci mikroRNA a onkogenní KRAS mutace pro stanovení včasné diagnózy a zhodnocení rizika vzniku karcinomu pankreatu.
1. 5. 2021 – 31. 12. 2024

Význam mutačního spektra nádorových buněk ve vývoji kolorektálního karcinomu
1. 5. 2022 – 31. 12. 2025

Vývoj genomové nestability a narušení integrity telomer u kolorektálního karcinomu
1. 5. 2022 – 31. 12. 2025

Význam mitochondriální DNA u nádorů tlustého střeva a konečníku
1. 1. 2020 – 30. 6. 2023

Vliv mikrobiálních metabolitů a diety na genom a epigenom při vzniku kolorektálního karcinomu
1. 7. 2021 – 30. 6. 2024

Homeostáza telomer od kolorektálního adenomu po metastatický nádor
1. 1. 2021 – 31. 12. 2025

Horizontální přenos mitochondrií v biologii rakoviny
1. 1. 2022 – 31. 12. 2024

Neinvazivní detekce cirkulujících mRNA markerů u onemocnění tlustého střeva a konečníku
2022–2025

Národní ústav pro výzkum rakoviny
2020–2023

Mezinárodní mobilita pracovníků Ústavu experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.

Publikace

A Combined Proteomics and Mendelian Randomization Approach to Investigate the Effects of Aspirin-Targeted Proteins on Colorectal Cancer.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiNounu A.Greenhough A.Heesom K.J.Richmond R.C.Zheng J.Weinstein S.J.Albanes D.Baron J.A.Hopper J.L.Figueiredo J.C.Newcomb P.A.Lindor N.M.Casey G.Platz E.A.Le Marchand L.Ulrich C.M.Li Ch.I.van Duijnhoven F.J.B.Gsur A.Campbell P.T.Moreno V.Vodička P.Vodičková L.Brenner H.Chang-Claude J.Hoffmeister M.Sakoda L.C.Slattery M.Schoen R.E.Gunter M.J.Castellvi-Bel S.Kim H.R.Kweon S.S.Chan A.Li L.Zheng W.Bishop D.T.Buchanan D.D.Giles G.G.Gruber S.B.Rennert G.Stadler Z.K.Harrison T.A.Lin Y.Keku T.O.Woods M.O.Schafmayer C.Van Guelpen B.Gallinger S.Hampel H.Berndt S.I.Pharoah P.D.P.Lindblom A.Wolk A.Wu A.N.H.White E.Peters U.Drew D.A.Scherer D.Bermejo J.L.Williams A.C.Relton C.L. Datum vydání 2021 Metadata Cancer Epidemiology Biomarkers a Prevention. 30(3): 564-575.

A Fecal MicroRNA Signature by Small RNA Sequencing Accurately Distinguishes Colorectal Cancers: Results From a Multicenter Study

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiPardini B. Ferrero G.Tarallo S.Gallo G.Francavilla A.Licheri N.Trompetto M.Clerico G.Senore C.Peyre S.Vymetálková V.Vodičková L.Liska V.Vycital O.Levy M.Macinga P.Hucl T.Budinska E.Vodička P.Cordero F.Naccarati A. Datum vydání 2023 Metadata Gastroenterology. 2023 May 30;S0016-5085(23)00811-9. doi: 10.1053/j.gastro.2023.05.037. Online ahead of print.

A genetic locus within the FMN1/GREM1 gene region interacts with body mass index in colorectal cancer risk

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiAglago E. K.Kim A. E.Lin Y.Qu C.Evangelou M.Ren Y.Morrison J.Albanes D.Arndt V.Barry E. L.Baurley J. W.Berndt S. I.Bien S. A.Bishop D. T.Bouras E.Brenner H.Buchanan D. D.Budiarto A.Carreras-Torres R.Casey G.Cenggoro T. W.Chan A. T.Chang-Claude J.Chen X.Conti D. V.Devall M.Díez-Obrero V.Dimou N.Drew D.Figueiredo J. C.Gallinger S.Giles G. G.Gruber S. B.Gsur A.Gunter M. J.Hampel H.Harlid S.Hidaka A.Harrison T. A.Hoffmeister M.Huyghe J. R.Jenkins M. A.Jordahl K.Joshi A. D.Kawaguchi E. S.Keku T. O.Kundaje A.Larsson S. C.Le Marchand L.Lewinger J. P.Li L.Lynch B. M.Mahesworo B.Mandic M.Obón-Santacana M.Moreno V.Murphy N.Nan H.Nassir R.Newcomb P. A.Ogino S.Ose J.Pai R. K.Palmer J. R.Papadimitriou N.Pardamean B.Peoples A. R.Platz E. A.Potter J. D.Prentice R. L.Rennert G.Ruiz-Narvaez E.Sakoda L. C.Scacheri P. C.Schmit S. L.Schoen R. E.Shcherbina A.Slattery M. L.Stern M. C.Su Y. R.Tangen C. M.Thibodeau S. N.Thomas D. C.Tian Y.Ulrich C. M.van Duijnhoven F. J. B.Van Guelpen B.Visvanathan K.Vodička P.Wang J.White E.Wolk A.Woods M. O.Wu A. H.Zemlianskaia N.Hsu L.Gauderman W. J.Peters U.Tsilidis K. K.Campbell P. T. Datum vydání 2023 Metadata Cancer Res . 2023 May 30;CAN-22-3713. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-22-3713. Online ahead of print.

A pooled analysis of molecular epidemiological studies on modulation of DNA repair by host factors.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiOpattová A.Langie S.A.S.Milic M.Collins A.Brevik A.Coskun E.Dusinská M.Gaivao I.Kadioglu E.Laffon B.Marcos R.Pastor S.Slyšková J.Smolková B.Szilagyi Z.Valdiglesias V.Vodička P.Volkovová K.Bonassi S.Godschalk R.W.L. Datum vydání 2022 Metadata Mutation Research – Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis. 876: 503447.

Adiposity, metabolites, and colorectal cancer risk: Mendelian randomization study.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiBull C.J.Bell J.A.Murphy N.Sanderson E.Smith G.D.Timpson N.J.Banbury B.L.Albanes D.Berndt S.I.Bezieau S.Bishop D. T.Brenner H.Buchanan D.D.Burnett-Hartman A.Casey G.Castellvi-Bel S.Chan A.Chang-Claude J.Cross A.J.de la Chapelle A.Figueiredo J.C.Gallinger S. J.Gapstur S.M.Giles G.G.Gruber S.B.Gsur A.Hampe J.Hampel H.Harrison T.A.Hoffmeister M.Hsu L.Huang W.Y.Huyghe J.R.Jenkins M. A.Joshu C.E.Keku T.O.Kuhn T.Kweon S.S.Le Marchand L.Li Ch.S.I.Li L.Lindblom A.Martin V.May A.M.Milne R.L.Moreno V.Newcomb P.A.Offit K.Ogino S.Phipps A.I.Platz E.A.Potter J.D.Qu C.Quiros J. R.Rennert G.Riboli E.Sakoda L.C.Schafmayer C.Schoen R.E.Slattery M.L.Tangen C.M.Tsilidis K.K.Ulrich C.M.van Duijnhoven F.J.B.van Guelpen B.Visvanathan K.Vodička P.Vodičková L.Wang H.S.White E.Wolk A.Woods M.O.Wu A.H.Campbell P.T.Zheng W.Peters U.Vincent E.E.Gunter M.J. Datum vydání 2020 Metadata BMC Medicine. 18(1): 396.

An investigation of DNA damage and DNA repair in chemical carcinogenesis triggered by small-molecule xenobiotics and in cancer: Thirty years with the comet assay.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiVodička P.Vodenková S.Horák J.Opattová A.Tomášová K.Vymetálková V.Stetina R.Hemminki K.Vodičková L. Datum vydání 2023 Metadata Mutation Research – Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis. 885: 503564.

Association between a polymorphic variant in the CDKN2B-AS1/ANRIL gene and pancreatic cancer risk.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiGiaccherini M.Farinella R.Gentiluomo M.Mohelnikova-Duchonová B.Kauffmann E.F.Palmeri M.Uzunoglu F.Souček P.Petrauskas D.Cavestro G.M.Zykus R.Carrara S.Pezzilli R.Puzzono M.Szentesi A.Neoptolemos J.Archibugi L.Palmieri O.Milanetto A.C.Capurso G.van Eijck C.H.J. Stocker H.Lawlor R.T.Vodička P.Loveček M.Izbicki J. R.Perri F.Kupcinskaite-Noreikiene R.Gotz M.Kupcinskas J.Hussein T.Hegyi P.Busch O.R.Hackert T.Mambrini A.Brenner H.Lucchesi M.Basso D.Tavano F.Schottker B.Vanella G.Bunduc S.Petranyi A.Landi S.Morelli L.Canzian F.Campa D. Datum vydání 2023 Metadata International Journal of Cancer. 153(2): 373-379.

Association of Genetic Variants Affecting microRNAs and Pancreatic Cancer Risk.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiLu Y.Corradi C.Gentiluomo M.López de Maturana E.Theodoropoulos G. E.Roth S.Maiello E.Morelli L.Archibugi L.Izbicki J. R.Sarlós P.Kiudelis V.Oliverius M.Nóbrega Aoki M.Vashist Y.van Eijck C. H. J.Gazouli M.Talar-Wojnarowska R.Mambrini A.Pezzilli R.Bueno-de-Mesquita B.Hegyi P.Souček P.Neoptolemos J. P.Di Franco G.Sperti C.Kauffmann E. F.Hlaváč V.Uzunoğlu F. G.Ermini S.Małecka-Panas E.Lucchesi M.Vanella G.Dijk F.Mohelníková-Duchoňová B.Bambi F.Petrone M. C.Jamroziak K.Guo F.Kolarova K.Capretti G.Milanetto A. C.Ginocchi L.Loveček M.Puzzono M.van Laarhoven H. W. M.Carrara S.Ivanauskas A.Papiris K.Basso D.Arcidiacono P. G.Izbéki F.Chammas R.Vodička P.Hackert T.Pasquali C.Piredda M. L.Costello-Goldring E.Cavestro G. M.Szentesi A.Tavano F.Włodarczyk B.Brenner H.Kreivenaite E.Gao X.Bunduc S.Vermeulen R. C. H.Schneider M. A.Latiano A.Gioffreda D.Testoni S. G. G.Kupcinskas J.Lawlor R. T.Capurso G.Malats N.Campa D.Canzian F. Datum vydání 2021 Metadata Frontiers in Genetics. 12: 693933.

Associations Between Glycemic Traits and Colorectal Cancer: A Mendelian Randomization Analysis.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiMurphy N.Song M.Papadimitriou N.Carreras-Torres R.Langenberg C.Martin R.M.Tsilidis K.K.Barroso I.Chen J.Frayling T.Bull C.J.Vincent E.E.Cotterchio M.Gruber S.B.Pai R.K.Newcomb P.A.Perez-Cornago A.van Duijnhoven F.J.B.Van Guelpen B.Vodička P.Wolk A.Wu A.H.Peters U.Chan A.T.Gunter M. Datum vydání 2022 Metadata JNCI-Journal of the National Cancer Institute. 114(5): 740-752.

Associations between pancreatic expression quantitative traits and risk of pancreatic ductal adenocarcinoma.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiPistoni L.Gentiluomo M.Lu Y.Maturana E.L.Hlaváč V.Vanella G.Darvasi E.Milanetto A.C.Oliverius M.Vashist Y.Di Leo M.Mohelniková-Duchoňová B.Talar-Wojnarowská R.Gheorghe C.Petrone M.Ch.Strobel O.Arcidiacono P.G.Vodičková L.Szentesi A.Capurso G.Gajdan L.Malleo G.Theodoropoulos G.E.Basso D.Souček P.Brenner H.Lawlor R.T.Morelli L.Ivanauskas A.Kauffmann E.F.Macauda A.Gazouli M.Archibugi L.Nentwich M.Cavestro G.M.Vodička P.Landi S.Tavano F.Sperti C.Hackert T.Kupcinskas J.Pezzilli R.Andriulli A.Pollina L.Kreivenaite E.Gioffreda D.Jamroziak K.Hegyi P.Izbicki J.R.Testoni S.G.G.Zuppardo R.A.Bozzato D.Neoptolemos J.P.Malats N.Canzian F.Campa D. Datum vydání 2021 Metadata Carcinogenesis. 42(8): 1037-1045.

Beyond GWAS of Colorectal Cancer: Evidence of Interaction with Alcohol Consumption and Putative Causal Variant for the 10q24.2 Region.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiJordahl K.M.Shcherbina A.Kim A.E.Su Y.R.Lin Y.Wang J.Qu C.Albanes D.Arndt V.Baurley J.W.Berndt S.I.Bien S.A.Bishop D.T.Bouras E.Brenner H.Buchanan D.D.Budiarto A.Campbell P.T.Carreras-Torres R.Casey G.Cenggoro T.W.Chan A.T.Conti D.V.Dampier C.H.Devall M.A.Diez-Obrero V.Dimou N.Drew D.A.Figueiredo J.C.Gallinger S.Giles G.G.Gruber S.B.Gsur A.Gunter M.J.Hampel H.Harlid S.Harrison T.A.Hidaka A.Hoffmeister M.Huyghe J.R.Jenkins M.A.Joshi A.D.Keku T.O.Larsson S.C.Marchand L.L.M.Lewinger J.P.Li L.Mahesworo B.Moreno V.Morrison J.L.Murphy N.Nan H.Nassir R.Newcomb P.A.Obon-Santacana M.Ogino S.Ose J.Pai R.K.Palmer J.R.Papadimitriou N.Pardamean B.Peoples A.R.Pharoah P.D.P.Platz E.A.Potter J.D.Prentice R.L.Rennert G.Ruiz-Narvaez E.A.Sakoda L.C.Scacheri P.C.Schmit S.L.Schoen R.E.Slattery M.L.Stern M.C.Tangen C.M.Thibodeau S.N.Thomas D.C.Tian Y.Tsilidis K.K.Ulrich C.M.Duijnhoven F.J.B.V.Guelpen B.V.Visvanathan K.Vodička P.White E.Wolk A.Woods M.O.Wu A.H.Zemlianskaia N.Chang-Claude J.Gauderman W.J.Hsu L.Kundaje A.Peters U. Datum vydání 2022 Metadata Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention. 31(5): 1077-1089.

Common variability in oestrogen-related genes and pancreatic ductal adenocarcinoma risk in women.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiPeduzzi G.Archibugi L.Katzke V.Gentiluomo M.Capurso G.Milanetto A.C.Gazouli M.Goetz M.Brenner H.Vermeulen R. Ch.Talar-Wojnarowská R.Vanella G.Tavano F.Lucchesi M.Mohelniková-Duchonová B.Chen X.Kiudelis V.Hegyi P.Oliverius M.Stocker H.Stornello C.Vodičková L.Souček P.Neoptolemos J.P.Testoni S.G.G.Morelli L.Lawlor R.T.Basso D.Izbicki J.R.Ermini S.Kupcinskas J.Pezzilli R.Boggi U.van Laarhoven H.W.M.Szentesi A.Erőss B.Capretti G.Schöttker B.Skieceviciene J.Aoki M.N.van Eijck C.H.J.Cavestro G.M.Canzian F.Campa D. Datum vydání 2022 Metadata Scientific Reports. 12(1):18100

Complex molecular profile of DNA repair genes in epithelial ovarian carcinoma patients with different sensitivity to platinum-based therapy.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiŠeborová K.Hlaváč V.Holý P.Bjørklund S.Fleischer T.Rob L.Hruda M.Bouda J.Mrhalová M.Al Obeed Allah M.M.Vodičková L.Vodička P.Fiala O.Souček P.Kristensen V.Václavíková R. Datum vydání 2022 Metadata Frontiers in Oncology. 12: 1016958.

Diagnostic and prognostic impact of cell-free DNA in human cancers: Systematic review

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiČervená K.Vodička P.Vymetálková V. Datum vydání 2019 Metadata Mutat Res Rev Mutat Res . 2019 Jul-Sep;781:100-129. doi: 10.1016/j.mrrev.2019.05.002. Epub 2019 May 11.

Differences in genome, transcriptome, miRNAome, and methylome in synchronous and metachronous liver metastasis of colorectal cancer

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiHorák J.Kubecek O.Šišková A.Hoňková K.Chvojková I.Krupova M.Manethova M.Vodenková S.García-Mulero S.John S.Cecka F.Vodičková L.Petera J.Filip S.Vymetálková V. Datum vydání 2023 Metadata Front Oncol . 2023 Apr 27;13:1133598. doi: 10.3389/fonc.2023.1133598. eCollection 2023.

Discovery of Long Non-Coding RNA MALAT1 Amplification in Precancerous Colorectal Lesions.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiŠišková A.Král J.Drabová J.Červená K.Tomášová K.Jungwirth J.Hucl T.Kohout P.Summerová S.Vodičková L.Vodička P.Vymetálková V. Datum vydání 2022 Metadata International Journal of Molecular Sciences. 23(14): 7656.

DNA Repair Gene Polymorphisms and Chromosomal Aberrations in Exposed Populations.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiNiazi Y.Thomsen H.Smolková B.Vodičková L.Vodenková S.Kroupa M.Vymetálková V.Kazimírová A.Barancoková M.Volkovová K.Staruchová M.Hoffmann P.Noethen M.M.Dusinska M.Musak L.Vodička P.Hemminki K.Foersti A. Datum vydání 2021 Metadata Frontiers in Genetics. 12: 691947.

DNA repair gene polymorphisms and chromosomal aberrations in healthy, nonsmoking population.

OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiNiazi Y.Thomsen H.Smolková B.Vodičková L.Vodenková S.Kroupa M.Vymetálková V.Kazimírová A.Barancoková M.Volkovová K.Staruchová M.Hoffmann P.Noethen M.Dusinská M.Musak L.Vodička P.Foersti A.Hemminki K. Datum vydání 2021 Metadata DNA Repair. 101: 103079.

Elucidating the Risk of Colorectal Cancer for Variants in Hereditary Colorectal Cancer Genes

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiThomas M.Qu C.Wang X.Huyghe J. R.Joo J. E.Georgeson P.Arndt V.Berndt S. I.Bézieau S.Bien S. A.Bishop D. T.Brenner H.Brezina S.Burnett-Hartman A.Campbell P. T.Casey G.Castellví-Bel S.Chan A. T.Chang-Claude J.Chen X.Conti D. V.Cremolini C.Diergaarde B.Figueiredo J. C.FitzGerald L. M.Gago-Dominguez M.Gallinger S.Giles G. G.Gsu A.Gunter M. J.Hampe J.Hampel H.Harrison T. A.Hoffmeister M.Keku T. O.Kundaje A.Le Marchand L.Lenz H.-J.Li C. I.Li L.Lin Y.Lindblom A.Moreno V.Murphy N.Newcomb P. A.Newton C. C.Obón-Santacana M.Ogino S.Pai R. K.Palmer J. R.Pearlman R.Pharoah P. D. P.Phipps A. I.Platz E. A.Potter J. D.Rennert G.Sakoda L. C.Schafmayer C.Schmit S. L.Schoen R. E.Slattery M. L.Stadler Z. K.Steinfelder R. S.Thibodeau S. N.Ulrich C. M.Um C. Y.van Duijnhoven F. J. B.Van Guelpen B.Visvanathan K.Vodička P.Vodičková L.Vymetálková V.Weinstein S. J.White E.Winship I. M.Wolk A.Gruber S. B.Jenkins M. A.Hsu L.Buchanan D. D.Peters U. Datum vydání 2023 Metadata Gastroenterology . 2023 Jul 14;S0016-5085(23)04770-4. doi: 10.1053/j.gastro.2023.06.032. Online ahead of print.

Evolution of the Parvalbumin Genes in Teleost Fishes after the Whole-Genome Duplication.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiMukherjee S.Bartoš O.Zdeňková K.Hanák P.Horká P.Musilová Z. Datum vydání 2021 Metadata Fishes. 6(4): 70.

Fecal microRNAs as non-invasive biomarkers for the detection of colorectal cancer: A systematic review

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiFrancavilla A.Tarallo S.Pardini B.Naccarati A. Datum vydání 2019 Metadata Minerva Biotecnologica. 31(1): 30-42.

Genetic architectures of proximal and distal colorectal cancer are partly distinct.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiHuyghe J.R.Harrison T.A.Bien S.A.Hampel H.Figueiredo J.C.Schmit S.L.Conti D.V.Chen S.Qu C.Lin Y.Barfield R.Baron J.A.Cross A.J.Diergaarde B.Duggan D.Harlid S.Imaz L.Kang H.M.Levine D.M.Perduca V.Perez-Cornago A.Sakoda L.C.Schumacher F.R.Slattery M.L.Toland A.E.van Duijnhoven F.J.B.Van Guelpen B.Agudo A.Albanes D.Alonso M.H.Anderson K.Arnau-Collell C.Arndt V.Banbury B.L.Bassik M.C.Berndt S.I.Bézieau S.B.Bishop D.T.Boehm J.Boeing H.Boutron-Ruault M.-C.Brenner H.Brezina S.Buch S.Buchanan D.D.Burnett-Hartman A.Caan B.J.Campbell P.T.Carr P.R.Castells A.Castellví-Bel S.Chan A.T.Chang-Claude J.Chanock S.J.Curtis K.R.de la Chapelle A.Easton D.F.English D.R.Feskens E.J.M.Gala M.Gallinger S.J.Gauderman W.J.Giles G.G.Goodman P.J.Grady W.M.Grove J.S.Gsur A.Gunter M.J.Haile R.W.Hampe J.Hoffmeister M.Hopper J.L.Hsu W.-L.Huang W.-Y.Hudson T.J.Jenab M.Jenkins M.A.Joshi A.D.Keku T.O.Kooperberg C.Kühn T.Küry S.Le Marchand L.Lejbkowicz F.Li C.I.Li L.Lieb W.Lindblom A.Lindor N.M.Männistö S.Markowitz S.D.Milne R.L.Moreno L.Murphy N.Nassir R.Offit K.Ogino S.Panico S.Parfrey P.S.Pearlman R.Pharoah P.D.P.Phipps A.I.Platz E.A.Potter J.D.Prentice R.L.Qi L.Raskin L.Rennert G.Rennert H.S.Riboli E.Schafmayer C.Schoen R.E.Seminara D.Song M.Su Y.-R.Tangen C.M.Thibodeau S.N.Thomas D.C.Trichopoulou A.Ulrich C.M.Visvanathan K.Vodička P.Vodičková L.Vymetálková V.Weigl K.Weinstein S.J.White E.Wolk A.Woods M.O.Wu A.H.Abecasis G.R.Nickerson D.A.Scacheri P.C.Kundaje A.Casey G.Gruber S.B.Hsu L.Moreno V.Hayes R.B.Newcomb P.A.Peters U. Datum vydání 2021 Metadata Gut. 70(7): 1325-1334.

Genetic determinants of telomere length and risk of pancreatic cancer: a PANDoRA study.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiCampa D.Matarazzi M.Greenhalf W.Bijlsma M.Saum K.U.Pasquali C.van Laarhoven H.Szentesi A.Federici F.Vodička P.Vodička P.Funel N.Pezzilli R.Bueno-de-Mesquita H. B.Vodičková L.Basso D.Obazee O.Hackert T.Souček P.Cuk K.Kaiser J.Sperti C.Loveček M.Capurso G.Mohelníková-Duchoňová B.Khaw K. T.König A.K.Kupcinskas J.Kaaks R.Bambi F.Archibugi L.Mambrini A.Cavestro G.M.Landi S.Hegyi P.Izbicki J.R.Gioffreda D.Zambon C.F.Tavano F.Talar-Wojnarowska R.Jamroziak K.Key T. J.Fave G.D.Strobel O.Jonaitis L.Andriulli A.Lawlor R.T.Pirozzi F.Katzke V.Valsuani Ch.Vashist Y.K.Brenner H.Canzian F. Datum vydání 2019 Metadata International Journal of Cancer. 144 (6):1275-1288.

Genetic Polymorphisms Involved in Mitochondrial Metabolism and Pancreatic Cancer Risk.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiPeduzzi G.Gentiluomo M.Tavano F.Arcidiacono P. G.Ermini S.Vodička P.Boggi U.Cavestro G. M.Capurso G.Morelli L.Milanetto A. C.Pezzilli R.Lawlor R. T.Carrara S.Lovecek M.Souček P.Guo F.Hackert T.Uzunoğlu F. G.Gazouli M.Párniczky A.Kupcinskas J.Bijlsma M. F.Bueno-de-Mesquita B.Vermeulen R.van Eijck C. H. J.Jamroziak K.Talar-Wojnarowska R.Greenhalf W.Gioffreda D.Petrone M. C.Landi S.Archibugi L.Puzzono M.Funel N.Sperti C.Piredda M. L.Mohelnikova-Duchonova B.Lu Y.Hlaváč V.Gao X.Schneider M.Izbicki J. R.Theodoropoulos G. E.Bunduc S.Kreivenaite E.Busch O. R.Małecka-Panas E.Costello E.Perri F.Testoni S. G. G.Vanella G.Pasquali C.Oliverius M.Brenner H.Loos M.Götz M.Georgiou K.Erőss B.Maiello E.Szentesi A.Bazzocchi F.Basso D.Neoptolemos J. P.Hegyi P.Kiudelis V.Canzian F.Campa D. Datum vydání 2021 Metadata Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention. 30 (12): 2342-2345.

Genetic Susceptibility in Understanding of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Risk: A Decade-Long Effort of the PANDORA Consortium.

OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiVodičková L.Horák J.Vodička P. Datum vydání 2022 Metadata Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention. 31(5): 942-948.

Genetic variability of the ABCC2 gene and clinical outcomes in pancreatic cancer patients

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiGentiluomo M.Garcia P.P.Galeotti A.A.Talar-Wojnarowska R.Tjaden C.Tavano F.Strobel O.Kupcinskas J.Neoptolemos J.Hegyi P.Costello E.Pezzilli R.Sperti C.Lawlor R.T.Capurso G.Szentesi A.Souček P.Vodička P.Loveček M.Hackert T.Cavestro G.M.Milanetto A.C.Canzian F.Campa D. Datum vydání 2019 Metadata Carcinogenesis. 2019 Jun 10;40(4):544-550. doi: 10.1093/carcin/bgz006.

Genetic variations in 3'UTRs of SMUG1 and NEIL2 genes modulate breast cancer risk, survival and therapy response.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiČumová A.Vymetálková V.Opattová A.Boušková V.Pardini B.Kopečkov K.Kozevnikovová R.Licková K.Ambrus M.Vodičková L.Naccarati A.Souček P.Vodička P. Datum vydání 2021 Metadata Mutagenesis. 36(4): 269-279.

Genetic variations in microRNA-binding sites of solute carrier transporter genes as predictors of clinical outcome in colorectal cancer.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiBendová P.Pardini B.Susová S.Rosendorf J.Levy M.Skrobánek P.Buchler T.Král J.Liska V.Vodičková L.Landi S.Souček, P.Naccarati A.Vodička P.Vymetálková V. Datum vydání 2021 Metadata Carcinogenesis. 42(3): 378-394.

Genetically predicted circulating concentrations of micronutrients and risk of colorectal cancer among individuals of European descent: a Mendelian randomization study.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiTsilidis K. K.Papadimitriou N.Dimou N.Gill D.Lewis S. J.Martin R. M.Murphy N.Markozannes G.Zuber V.Cross A. J.Burrows K.Lopez D. S.Key T. J.Travis R. C.Perez-Cornago A.Hunter D. J.van Duijnhoven F. J. B.Albanes D.Arndt V.Berndt S. I.Bézieau S.Bishop D. T.Boehm J.Brenner H.Burnett-Hartman A.Campbell P. T.Casey G.Castellví-Bel S.Chan A. T.Chang-Claude J.de la Chapelle A.Figueiredo J. C.Gallinger S. J.Giles G. G.Goodman P. J.Gsur A.Hampe J.Hampel H.Hoffmeister M.Jenkins M. A.Keku T. O.Kweon S.-S.Larsson S. C.Le Marchand L.Li C. I.Li L.Lindblom A.Martín V.Milne R. L.Moreno V.Nan H.Nassir R.Newcomb P. A.Offit K.Pharoah P. D. P.Platz E. A.Potter J. D.Qi L.Rennert G.Sakoda L. C.Schafmayer C.Slattery M. L.Snetselaar L.Schenk J.Thibodeau S. N.Ulrich C. M.Van Guelpen B.Harlid S.Visvanathan K.Vodičková L.Wang H.White E.Wolk A.Woods M. O.Wu A. H.Zheng W.Bueno-de-Mesquita B.Boutron-Ruault M.-C.Hughes D. J.Jakszyn P.Kühn T.Palli D.Riboli E.Giovannucci E. L.Banbury B. L.Gruber S. B.Peters U.Gunter M. J. Datum vydání 2021 Metadata Journal of Clinical Nutrition. 113(6): 1490-1502.

Genome-wide Interaction Study with Smoking for Colorectal Cancer Risk Identifies Novel Genetic Loci Related to Tumor Suppression, Inflammation, and Immune Response.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiCarreras-Torres R.Kim A.E.Lin Y.Diez-Obrero V.Bien S.A.Qu C.H.Wang J.Dimou N.Aglago E.K.Albanes D.Arndt V.Baurley J.W.Berndt S.I.Bezieau S.Bishop D.T.Bouras E.Brenner H.Budiarto A.Campbell P.T.Casey G.Chan A.T.Chang-Claude J.Chen X.Conti D.Dampier Ch.Devall M.A.M.Drew D.A.Figueiredo J.C.Gallinger S.Giles G.G.Gruber S.B.Gsur A.Gunter M.J.Harrison T.Hidaka A.Hoffmeister M.Huyghe J.Jenkins M.A.Jordahl K.M.Kawaguchi E.Keku T.O.Kundaje A.Le Marchand L.Lewinger J.P.Li L.Mahesworo B.Morrison J. L.Murphy N.Nan H.Nassir R.Newcomb P.A.Obon-Santacana M.Ogino S.Ose J.Pai R.K.Palmer J.R.Papadimitriou N.Pardamean B.Peoples A.R.Pharoah P.D.P.Platz E.A.Rennert G.Ruiz-Narvaez E.Sakoda L.C.Scacheri P.C.Schmit S.L.Schoen R.E.Shcherbina A.Slattery M.L.Stern M.C.Su Y.R.Tangen C.M.Thomas D.C. Tian Y.Tsilidis K.K.Ulrich C.M.van Duijnhoven F.J.B.Van Guelpen B.Visvanathan K.Vodička P.Cenggoro T.W.Weinstein S. J.White E.Wolk A.Woods M.O.Hsu L.Peters U.Moreno V.Gauderman W.J. Datum vydání 2023 Metadata Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention. 32(3): 315-328.

Genome-wide meta-analysis of monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS) identifies risk loci impacting IRF-6.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiClay-Gilmour A.Chattopadhyay S.Hildebrandt M.A.T.Thomsen H.Weinhold N.Vodička P.Vodičková L.Hoffmann P.Nothen M.M.Jockel K.H.Schmidt B.Langer Ch.Hájek R.Hallmans G.Pettersson-Kymmer U.Ohlsson C.Spath F.Houlston R.Goldschmidt H.Manasanch E.E.Norman A.Kumar S.Rajkumar S.V.Slager S.Forsti A.Vachon C.M.Hemminki K. Datum vydání 2022 Metadata Blood Cancer Journal. 12(4):60

Genome-wide Modeling of Polygenic Risk Score in Colorectal Cancer Risk.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiThomas M.Sakoda L. C.Hoffmeister M.Rosenthal E. A.Lee J. K.van Duijnhoven F. J. B.Platz E. A.Wu A. H.Dampier C. H.de la Chapelle A.Wolk A.Joshi A. D.Burnett-Hartman A.Gsur A.Lindblom A.Castells A.Win A. K.Namjou B.Van Guelpen B.Tangen C. M.He Q.Li C. I.Schafmayer C.Joshu C. E.Ulrich C. M.Bishop D. T.Buchanan D. D.Schaid D.Drew D. A.Muller D. C.Duggan D.Crosslin D. R.Albanes D.Giovannucci E. L.Larson E.Qu F.Mentch F.Giles G. G.Hakonarson H.Hampel H.Stanaway I. B.Figueiredo J. C.Huyghe J. R.Minnier J.Chang-Claude J.Hampe J.Harley J. B.Visvanathan K.Curtis K. R.Offit K.Li L.Le Marchand L.Vodickova L.Gunter M. J.Jenkins M. A.Slattery M. L.Lemire M.Woods M. O.Song M.Murphy N.Lindor N. M.Dikilitas O.Pharoah P. D. P.Campbell P. T.Newcomb P. A.Milne R. L.MacInnis R. J.Castellví-Bel S.Ogino S.Berndt S. I.Bézieau S.Thibodeau S. N.Gallinger S. J.Zaidi S. H.Harrison T. A.Keku T. O.Hudson T. J.Vymetálková V.Moreno V.Martín V.Arndt V.Wei W.-Q.Chung W.Su Y.-R.Hayes R. B.White E.Vodička P.Casey G.Gruber S. B.Schoen R. E.Chan A. T.Potter J. D.Brenner H.Jarvik G. P.Corley D. A.Peters U.Hsu L. Datum vydání 2020 Metadata American Journal of Human Genetics. 107(3): 432-444.

Genome-wide scan of long noncoding RNA single nucleotide polymorphisms and pancreatic cancer susceptibility.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiCorradi C.Gentiluomo M.Gajdan L.Cavestro G.M.Kreivenaite E.Di Franco G.Sperti C.Giaccherini M.Petrone M. Ch.Tavano F.Gioffreda D.Morelli L.Souček P.Andriulli A.Izbicki J.R.Napoli N.Malecka-Panas E.Hegyi P.Neoptolemos J.P.Landi S.Vashist Y.Pasquali C.Lu Y.Červená K.Theodoropoulos G.Moz S.Capurso G.Strobel O.Carrara S.Hackert T.Hlaváč V.Archibugi L.Oliverius M.Vanella G.Vodička P.Arcidiacono P.G.Pezzilli R.Milanetto A.C.Lawlor R.T.Ivanauskas A.Szentesi A.Kupcinskas J.Testoni S.G.G.Loveček M.Nentwich M.Gazouli M.Luchini C.Zuppardo R.A.Darvasi E.Brenner H.Gheorghe C.Jamroziak K.Canzian F.Campa D. Datum vydání 2021 Metadata International Journal of Cancer. 148(11): 2779-2788.

Glyphosate Interaction with eEF11 Indicates Altered Protein Synthesis: Evidence for Reduced Spermatogenesis and Cytostatic Effect.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiSopko B.Tejral G.Bitti G.Sainz J.Garcia-Verdejo F.J.Martinez-Bueno M.Kumar A.Sanchez-Maldonado J.M.Diez-Villanueva A.Vodičková L.Vymetálková V.Sanchez V.M.Da Silva F.M.I.Sampaio-Marques B.Březina S.Butterbach K.ter Horst R.Hoffmeister M.Ludovico P.Jurado M.Li Y.Abate M.Medvediková M.Hajduch M.Chloupek J.Fajmonová J.Skoric M.Amler E.Erban T. Datum vydání 2021 Metadata ACS Omega. 6(23):14848-14857.

Huntingtin Co-Isolates with Small Extracellular Vesicles from Blood Plasma of TgHD and KI-HD Pig Models of Huntington's Disease and Human Blood Plasma.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiAnanbeh H.Novák J.Juhas S.Juhasova J.Klempir J.Doleckova K.Rysankova I.Turnovcová K.Hanus J.Hansikova H.Vodička P.Skalnikova Kupcova H. Datum vydání 2022 Metadata International Journal of Molecular Sciences. 23(10): 5598.

Identification of Recessively Inherited Genetic Variants Potentially Linked to Pancreatic Cancer Risk.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiLu Y.Gentiluomo M.Gioffreda D.Gazouli M.Petrone M. C.Kelemen D.Ginocchi L.Morelli L.Papiris K.Greenhalf W.Izbicki J. R.Kiudelis V.Mohelníková-Duchoňová B.Bueno-de-Mesquita B.Vodička P.Brenner H.Diener M. K.Pezzilli R.Ivanauskas A.Salvia R.Szentesi A.Aoki M. N.Németh B. C.Sperti C.Jamroziak K.Chammas R.Oliverius M.Archibugi L.Ermini S.Novák J.Kupcinskas J.Strouhal O.Souček P.Cavestro G. M.Milanetto A. C.Vanella G.Neoptolemos J. P.Theodoropoulos G. E.van Laarhoven H. W. M.Mambrini A.Moz S.Kala Z.Loveček M.Basso D.Uzunoglu F. G.Hackert T.Testoni S. G. G.Hlaváč V.Andriulli A.Lucchesi M.Tavano F.Carrara S.Hegyi P.Arcidiacono P. G.Busch O. R.Lawlor R. T.Puzzono M.Boggi U.Guo F.Małecka-Panas E.Capurso G.Landi S.Talar-Wojnarowska R.Strobel O.Gao X.Vashist Y.Campa D.Canzian F. Datum vydání 2021 Metadata Frontiers in Oncology. 11: 771312.

Identifying novel susceptibility genes for colorectal cancer risk from a transcriptome-wide association study of 125,478 subjects.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiGuo X.Lin W.Wen W.Huyghe J.Bien S.Cai Q.Harrison T.Chen Z.Qu C.Bao J.Long J.Yuan Y.Wang F.Bai M.Abecasis G.R.Albanes D.Berndt S.I.Bézieau S.Bishop D.T.Brenner H.Buch S.Burnett-Hartman A.Campbell P.T.Castellví-Bel S.Chan A.T.Chang-Claude J.Chanock S.J.Cho S.H.Conti D.V.de la Chapelle A.Feskens E.J.M.Gallinger S.J.Giles G.G.Goodman P.J.Gsur A.Guinter M.Gunter M.J.Hampe J.Hampel H.Hayes R.B.Hoffmeister M.Kampman E.Kang H.M.Keku T.O.Kim H.R.Le Marchand L.Lee S.C.Li C.I.Li L.Lindblom A.Lindor N.Milne R.L.Moreno V.Murphy N.Newcomb P.A.Nickerson D.A.Offit K.Pearlman R.Pharoah P.D.P.Platz E.A.Potter J.D.Rennert G.Sakoda L.C.Schafmayer C.Schmit S.L.Schoen R.E.Schumacher F.R.Slattery M.L.Su Y.-R.Tangen C.M.Ulrich C.M.van Duijnhoven F.J.B.van Guelpen B.Visvanathan K.Vodička P.Vodičková L.Vymetálková V.Wang X.White E.Wolk A.Woods M.O.Casey G.Hsu L.Jenkins M.A.Gruber S.B.Peters U.Zheng W. Datum vydání 2021 Metadata Gastroenterology. 160(4) 1164–1178.

International database comparison of results with the comet assay in human biomonitoring. Baseline frequency of DNA damage and effect of main confounders.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů Oddělení nanotoxikologie a molekulární epidemiologie AutořiMilić M.Ceppi M.Bruzzone M.Azqueta A.Brunborg G.Godschalk R.Koppen G.Langie S.Møller P.Teixeira J. P.Alija A.Anderson D.Andrade V.Andreoli C.Asllani F.Bangkoglu E. E.Barančoková M.Basaran N.Boutet-Robinet E.Buschini A.Cavallo D.Pereira C. C.Costa C.Costa S.Da Silva J.Del Bo‘ C.Srećković V. D.Djelić N.Dobrzyńska M.Duračková Z.Dvořáková M.Gajski G.Galati S.García Lima O.Giovannelli L.Goroshinskaya I. A.Grindel A.Gutzkow K. B.Hernández A.Hernández C.Holven K. B.Ibero-Baraibar I.Ottestad I.Kadioglu E.Kažimirová A.Kuznetsova E.Ladeira C.Laffon B.Lamonaca P.Lebailly P.Louro H.Cardoso T. M.Marcon F.Marcos R.Moretti M.Moretti S.Najafzadeh M.Nemeth Z.Neri M.Novotna B.Orlow I.Paduchova Z.Pastor S.Perdry H.Spremo-Potparević B.Ramadhani D.Riso P.Rohr P.Rojas E.Rössner P.Safar A.Sardas S.Silva M. J.Sirota N.Smolkova B.Staruchova M.Stetina R.Stopper H.Surikova E. I.Ulven S. M.Ursini C. L.Valdiglesias V.Valverde M.Vodička P.Volkovova K.Wagner K.-H.Živković L.Dušinská M.Collins A. R.Bonassi S. Datum vydání 2021 Metadata Mutation Research-Reviews in Mutation Research. 787: 108371.

Lack of association of CD44-rs353630 and CHI3L2-rs684559 with pancreatic ductal adenocarcinoma survival.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiGentiluomo M.Corradi Ch.Vanella G.Johansen A. Z.Strobel O.Szentesi A.Milanetto A.Hegyi P.Kupcinskas J.Tavano F.Neoptolemos J.P.Bozzato D.Hackert T.Pezzilli R.Johansen J.S.Costello E.Mohelniková-Duchonová B.van Eijck C.H.J.Talar-Wojnarowská R.Hansen C.P.Darvasi E.Chen I.Cavestro G.M.Souček P.Piredda L.Vodička P.Gazouli M.Arcidiacono P.G.Canzian F.Campa D.Capurso G. Datum vydání 2021 Metadata Scientific Reports. 11(1): 7570.

Local Immune Changes in Early Stages of Inflammation and Carcinogenesis Correlate with the Collagen Scaffold Changes of the Colon Mucosa.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiČaja F.Stakheev D.Chernyavskiy O.Kubinová L.Krizan J.Dvořák J.Rossmann P.Štěpánková R.Makovický P.Makovický P.Vymetálková V.Souček P.Vodička P.Vodičková L.Levý M.Vannucci L. Datum vydání 2021 Metadata Cancers. 13(10): 2463.

MALAT1 in colorectal cancer: Its implication as a diagnostic, prognostic, and predictive biomarker.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiČervená K.Vodenková S.Vymetálková V. Datum vydání 2022 Metadata Gene. 843: 146791.

Marine Cellulases and their Biotechnological Significance from Industrial Perspectives.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiNavvabi A.Homaei A.Pletschke B.Navvabi N.Kim S.K. Datum vydání 2022 Metadata Current Pharmaceutical Design. 28(41): 3325-3336.

Measuring DNA modifications with the comet assay: a compendium of protocols

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiCollins A.Møller P.Gajski G.Vodenková S.Abdulwahed A.Anderson D.Bankoglu E. E.Bonassi S.Boutet-Robinet E.Brunborg G.Chao C.Cooke M. S.Costa C.Costa S.Dhawan A.de Lapuente J.Del Bo' C.Dubus J.Dusinska M.Duthie S. J.El Yamani N.Engelward B.Gaivão I.Giovannelli L.Godschalk R.Guilherme S.Gutzkow K. B.Habas K.Hernández A.Herrero O.Isidori M.Jha A. N.Knasmüller S.Kooter I. M.Koppen G.Kruszewski M.Ladeira C.Laffon B.Larramendy M.Le Hégarat L.Lewies A.Lewinska A.Liwszyc G. E.López de Cerain A.Manjanatha M.Marcos R.Milić M.Moraes de Andrade V.Moretti M.Muruzabal D.Novak M.Oliveira R.Olsen A. K.Owiti N.Pacheco M.Pandey A. K.Pfuhler S.Pourrut B.Reisinger K.Rojas E.Rundén-Pran E.Sanz-Serrano J.Shaposhnikov S.Sipinen V.Smeets K.Stopper H.Teixeira J. P.Valdiglesias V.Valverde M.van Acker F.van Schooten F. J.Vasquez M.Wentzel J. F.Wnuk M.Wouters A.Žegura B.Zikmund T.Langie S. A. S.Azqueta A. Datum vydání 2023 Metadata Nat Protoc . 2023 Mar;18(3):929-989. doi: 10.1038/s41596-022-00754-y. Epub 2023 Jan 27.

MiR-140 leads to MRE11 downregulation and ameliorates oxaliplatin treatment and therapy response in colorectal cancer patients.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiHorák J.Dolníková A.Cumaogullari O.Čumová A.Navvabi N.Vodičková L.Levy M.Schneiderová M.Liška V.Andera L.Vodička P.Opattová A. Datum vydání 2022 Metadata Frontiers in Oncology. 12:959407.

Monitoring of telomere dynamics in peripheral blood leukocytes in relation to colorectal cancer patients' outcomes.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiTomášová K.Kroupa M.Zinková A.Korabečná M.Vymetálková V.Skrobánek P.Sojka L.Levy M.Hemminki K.Liška V.Hošek P.Kumar R.Vodičková L.Vodička P. Datum vydání 2022 Metadata Frontiers in Oncology. 12:962929.

MUC13-miRNA-4647 axis in colorectal cancer: Prospects to identifications of risk factors and clinical outcomes.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiSojka L.Opattová A. Bartů L.Horák J.Kořenková V.Novosadová V.Krížková V.Bruha J.Liška V.Schneiderová M.Kubecek O.Vodičková L.Urbanová M.Simsa J.Vodička P.Vymetálková V. Datum vydání 2023 Metadata Oncology Letters. 25 (2): 72.

Mutational analysis of driver genes defines the colorectal adenoma: in situ carcinoma transition.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiJungwirth J.Urbanová M.Boot A.Hošek P.Bendová P.Šišková A.Švec J.Kment M.Tůmová D.Summerová S.Beneš Z.Buchler T.Kohout P.Hucl T.Matěj R.Vodičková L.van Wezel T.Vodička P.Vymetálková V. Datum vydání 2022 Metadata Scientific Reports. 12(1): 2570.

Mutational Characterization of Cutaneous Melanoma Supports Divergent Pathways Model for Melanoma Development.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiMillan-Esteban D.Pena-Chilet M.Garcia-Casado Z.Manrique-Silva E.Requena C.Banuls J.Lopez-Guerrero J.A.Rodriguez-Hernandez A.Traves V.Dopazo J.Viróz A.Kunar R.Nagore E. Datum vydání 2021 Metadata Cancers. 13(20): 5219.

Mutational landscape of plasma cell-free DNA identifies molecular features associated with therapeutic response in patients with colon cancer. A pilot study.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiČervená K.Pardini B.Urbanová M.Vodenková S.Pazourková E.Veškrnová V.Levy M.Buchler T.Mokrejs M.Naccarati A.Vodička P.Vymetálková V. Datum vydání 2021 Metadata Mutagenesis. 36(5): 358-268.

Non-Coding RNAs as Biomarkers of Tumor Progression and Metastatic Spread in Epithelial Ovarian Cancer.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiŠeborová K.Václavíková R.Rob L.Souček P.Vodička P. Datum vydání 2021 Metadata Cancers. 13(8): 1839.

Oxidative Damage in Sporadic Colorectal Cancer: Molecular Mapping of Base Excision Repair Glycosylases MUTYH and hOGG1 in Colorectal Cancer Patients.

OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiKavec M.Urbanová M.Makovický P.Opattová A.Tomášová K.Kroupa M.Kostovciková K.Šišková A.Navvabi N.Schneiderová M.Vymetálková V.Vodičková L.Vodička P. Datum vydání 2022 Metadata International Journal of Molecular Sciences. 23(10): 5704.

Polygenic and multifactorial scores for pancreatic ductal adenocarcinoma risk prediction.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiGaleotti A.A.Gentiluomo M.Rizzato C.Obazee O.Neoptolemos J.P.Pasquali C.Nentwich M.Cavestro G.M.Pezzilli R.Greenhalf W.Holleczek B.Schroeder C.Schöttker B.Ivanauskas A.Ginocchi L.Key T.J.Hegyi P.Archibugi L.Darvasi E.Basso D.Sperti C.Bijlsma M.F.Palmieri O.Hlaváč V.Talar-Wojnarowská R.Mohelniková-Duchoňová B.Hackert T.Vashist Y.Strouhal O.Laarhoven H.Tavano F.Loveček M.Dervenis Ch.Izbéki F.Padoan A.Małecka-Panas E.Maiello E.Vanella G.Capurso G.Izbicki J.R.Theodoropoulos G.E.Jamroziak K.Katzke V.Kaaks R.Mambrini A.Papanikolaou I.S.Szmola R.Szentesi A.Kupcinskas J.Bursi S.Costello E.Boggi U.Milanetto A.C.Landi S.Gazouli M.Vodičková L.SoučekGioffreda D.Gemignani D.Brenner H.Strobel O.Büchler M.Vodička P.Paiella S.Canzian F.Campa D. Datum vydání 2021 Metadata Journal of Medical Genetics. 58(6): 369-377.

Polymorphisms within Autophagy-Related Genes Influence the Risk of Developing Colorectal Cancer: A Meta-Analysis of Four Large Cohorts.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiSainz J.Garcia-Verdejo F.J.Martinez-Bueno M.Kumar A.Sanchez-Maldonado J.M.Diez-Villanueva A.Vodičková L.Vymetálková V.Sanchez V.M.Da Silva F.M.I.Sampaio-Marques B.Březina S.Butterbach K.ter Horst R.Hoffmeister M.Ludovico P.Jurado M.Sanchez-Rovira P.Netea M.G.Gsur A.Vodička P.Moreno V.Hemminki K.Brenner H.Chang-Claude J.Forsti A. Datum vydání 2021 Metadata Cancer. 13(6):1258.

Positive Attributes of Anti-TERT CD4 T-Helper Type 1 Immune Responses in Melanoma.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiNagore E.Virós A.Kumar R. Datum vydání 2022 Metadata Journal of Investigative Dermatology. 142(2): 279-281.

Salicylic Acid and Risk of Colorectal Cancer: A Two-Sample Mendelian Randomization Study.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiNounu A.Richmond R.C.Stewart I.D.Surendran P.Wareham N.J.Butterworth A.Weinstein S.J.Albanes D.Baron J.A.Hopper J.L.Figueiredo J.C.Newcomb P.A.Lindor N.M.Casey G.Platz E.A.Marchand L.L.Ulrich C.M.Li Ch.I.van Dujinhoven F.J.B.Gsur A.Campbell P.T.Vodička P.Vodičková L.Amitay E.Alwers E.Chang-Claude J.Sakoda L.C.Slattery M.L.Schoen R.E.Gunter M.J.Castellví-Bel S.Kim H.R.Kweon S.S.Chan A.T.Li L.Zheng W.Bishop D.T.Buchanan D.D.Giles G.G.Gruber S.B.Rennert G.Stadler Z.K.Harrison T.A.Lin Y.Keku T.O.Woods M.O.Schafmayer C.Guelpen B.V.Gallinger S.Hampel H.Berndt S.I.Pharoah P.D.P.Lindblom A.Wolk A.Wu A.H.White E.Peters U.Drew D.A.Scherer D.Bermejo J.L.Brenner H.Hoffmeister M.Williams A.C.Relton C.L. Datum vydání 2021 Metadata Nutrients. 13(11):4164.

Telomere length in peripheral blood lymphocytes related to genetic variation in telomerase, prognosis and clinicopathological features in breast cancer patients.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů Oddělení genetické toxikologie a epigenetiky AutořiKroupa M.Rachakonda S.Vymetálková V.Tomášová K.Liška V.Vodenková S.Čumová A.Rössnerová A.Vodičková L.Hemminki K.Souček P.Kumar R.Vodička P. Datum vydání 2020 Metadata Mutagenesis. 35(6):491-497.

Telomeric repeat-containing RNA (TERRA): Physiological functions and relevance in cancer.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiKroupa M.Tomášová K.Kavec M.Skrobanek P.Buchler T.Kumar R.Vodičková L.Vodička P. Datum vydání 2022 Metadata Frontiers in Oncology. 12: 913314.

The Associations of Selenoprotein Genetic Variants with the Risks of Colorectal Adenoma and Colorectal Cancer: Case-Control Studies in Irish and Czech Populations.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiMukhtar M.Ashfield N.Vodičková L.Vymetálková V.Levy M.Liska V.Bruha J.Bendová P.O‘Sullivan J.Doherty G.Sheahan K.Nolan B.Vodička P.Hughes D. Datum vydání 2022 Metadata Nutrients. 14(13): 2718.

The dynamics of telomere length in primary and metastatic colorectal cancer lesions

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiKroupa M.Kubecek O.Tomášová K.Hanák P.Krupová M.Červená K.Šišková A.Rosendorf J.Hosek P.Vodičková L.Vodička P.Liška V.John S.Vymetálková V.Petera J. Datum vydání 2023 Metadata Sci Rep . 2023 Jun 5;13(1):9097. doi: 10.1038/s41598-023-35835-9.

The Interactions of DNA Repair, Telomere Homeostasis, and p53 Mutational Status in Solid Cancers: Risk, Prognosis, and Prediction.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiVodička P.Andera L.Opattová A.Vodičková L. Datum vydání 2021 Metadata Cancer. 13(3): 479.

Truncated PPM1D impairs response to genotoxic stress and promotes growth of APCmin induced tumors in mouse colon.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiBurocziová M.Burdová K.Vieru A.S.Kasparek P.Kleiblová P.Danielsen S.A.Zemanková P.Jeniková G.Pavel J.Tichá I.Xiao-Feng S.Janečková L.Borecká M.Schneiderová M.Schwarzová L.Vodičková L.Vodička P.Jirásková K.Liska V.Sedláček R.Kleibl Z.Ragenhild L.Kořínek V.Macurek L. Datum vydání 2019 Metadata Cell Death and Disease. 10: 818.

Validation of a Genetic-Enhanced Risk Prediction Model for Colorectal Cancer in a Large Community-Based Cohort.

 OdděleníOddělení molekulární biologie nádorů AutořiSu Y.R.Sakoda L.C.Jeon J.Thomas M.Lin Y.Schneider J.L.Udaltsová N.Lee J.K.Lansdorp-Vogelaar I.Peterse E.F.P.Zauber A.G.Zheng J.Y.Zheng Y.Y.Hauser E.Baron J.A.Barry E.L.Bishop D.T.Brenner H.Buchanan D.D.Burnett-Hartman A.Campbell P.T.Casey G.Castellvi-Bel S.Chan A.T.Chang-Claude J.Figueiredo J.C.Gallinger S.J.Giles G.G.Gruber S.B.Gsur A.Gunter M.J.Hampe J.Hampel H.Harrison T.A.Hoffmeister M.Hua X.W.Huyghe J.R.Jenkins M.A.Keku T.O.Le Marchand L.Li L.Lindblom A.Moreno V.Newcomb P.A.Pharoah P.D.P.Platz E.A.Potter J.D.Qu C.Rennert G.Schoen R.E.Slattery M.L.Song M.Y.van Duijnhoven F.J.B.Van Guelpen B.Vodička P.Wolk A.Woods M.O.Wu A.H.Hayes R.B.Peters U.Corley D.A.Hsu L. Datum vydání 2023 Metadata Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention. 32(3): 353-362.

Spolupráce