14. 06. 2024
Čtení na 2 minuty
ÚEM AV ČR jako první, a zatím jediné pracoviště v ČR, nově disponuje také dalším unikátním přístrojem Visium CytAssist od společnosti 10x Genomics (otevře se v novém okně), čímž významným způsobem rozšířil portfolio sdílených technologií nejen v oblasti Single Cell, ale též Spatial Transcriptomics.
Tento kompaktní přístroj umožňuje provádět prostorovou transkriptomiku s použitím moderní technologie Visium HD (otevře se v novém okně). CytAssist je kompatibilní s řezy tkání FFPE obarvenými hematoxylinem a eozinem (H&E), nebo imunofluorescenčně (IF). Přístroj provádí analýzu předpřipravených tkání na standardním laboratorním sklíčku, což zjednodušuje pracovní postup pro provedení prostorové transkriptomiky a dále výběr analyzované plochy přesným zarovnáním těchto úseků v oblasti zachycení preparátu. Součástí pracovního postupu s použitím Visium CytAssist je krájení, deparafinizace, barvení a zobrazování (H&E nebo IF) na standardním sklíčku. Po hybridizaci sondy se použijí dvě standardní laboratorní sklíčka a jedno Visium HD sklíčko. Sklíčka jsou umístěna do přístroje CytAssist tak, aby mohly být přeneseny hybridizované sondy z tkáňových řezů mezi různými typy sklíček.
Toto jedinečné a moderní zařízení bylo pořízeno v rámci infrastruktury EATRIS-CZ (otevře se v novém okně), která propojuje a usnadňuje spolupráci špičkových národních výzkumných institucí a nemocnic. EATRIS-CZ napomáhá rozvoji nových poznatků a řadí Českou republiku mezi národně i mezinárodně uznávaná centra excelence v molekulární a translační medicíně.