Přeskočit na hlavní obsah
Logo Ústav experimentální medicíny - přejít na domovskou stránku
  • O nás
    • Základní informace
    • Vedení a struktura
    • Povinně zveřejňované informace
      • Poskytování informací ze zákona
      • Veřejné zakázky
      • Výroční zprávy
    • Politika ÚEM AV ČR
      • Etický kodex
      • Genderová politika
      • HR Award
      • Politika ochrany soukromí
      • Politika správy výzkumných dat
      • Vnitřní oznamovací systém
  • Aktuality a události
    • Aktuality
    • Události
  • Výzkum
    • Výzkumná oddělení a centra
    • Servisní skupina mikroskopie
    • Projekty
    • Výzkumné infrastruktury
    • Publikace
    • Patenty
  • Studium a kariéra
  • Veřejnost a média
    • Pro média
    • Popularizace vědy
  • Kontakty
  • CZ
  • EN
Přihlášení
  • CZ
  • EN
Domů Arzuv Čaryjeva
Arzuv Čaryjeva

Data manažerka

Arzuv Čaryjeva, Ph.D.

Telefonní číslo +420 777 484 556
Mailová adresa arzuv.caryjeva@iem.cas.cz
Přeskočit navigaci
  • Oddělení

Oddělení

Sekretariát ředitelky

Vedoucí oddělení

Miroslava Anděrová


Patička

Buďte s námi v kontaktu

Sledujte nejnovější informace z ÚEM AV ČR prostřednictvím našich sociálních sítí.

  • +420 241 062 230
  • iem@iem.cas.cz
  • Vídeňská 1083, 142 00, Praha 4 Odkaz se otevře v novém okně
Facebook Instagram Youtube Linkedin
Přeskočit sekci instagram
Sleduj nás na instagramu

iemcas

🇨🇿 Biomedicínským výzkumem k efektivní diagnostice a léčbě
🇬🇧 Biomedical research towards effective diagnosis and treatment

💡 Věděli jste, že…? Kolokalizace je pojem 💡 Věděli jste, že…?

Kolokalizace je pojem používaný především v mikroskopii a buněčné biologii. 🔬 Označuje situaci, kdy se dva (nebo více) fluorescenčně značené objekty v buňce nacházejí v těsné blízkosti – a jejich signály se tedy prostorově překrývají.

To může naznačovat, že:

👉 dvě molekuly (např. bílkoviny) spolu interagují,
👉 jsou součástí stejné buněčné struktury (např. organely),
👉 nebo že probíhá určitý biologický proces na konkrétním místě.

Jak se kolokalizace sleduje?

Pomocí molekulárně-biologických nebo chemických metod se k sledovaným proteinům připojí značky různých barev (např. červená a zelená). 🔴🟢 Pokud se následně na snímku z fluorescenčního mikroskopu objeví žlutá barva 🟡 (tedy kombinace červené a zelené), znamená to, že objekty se nacházejí v těsné blízkosti (tj. kolokalizace). Míru kolokalizace a její změny je následně možné přesně popsat pomocí pokročilých nástrojů, jako je například Kymolyzer (viz předchozí příspěvek). 😉

🇬🇧

💡 Did you know that…?

Colocalisation is a term used primarily in microscopy and cell biology. 🔬 It refers to a situation where two (or more) fluorescently labelled objects are located in close proximity to each other, and their signals therefore overlap spatially.

What does this mean?

👉 That two molecules (e.g. proteins) interact with each other.
👉 They are part of the same cell structure (e.g. organelles).
👉 That a certain biological process is taking place at a specific location.

How is colocalisation detected?

Using molecular biology or chemical methods, different colored dyes (e.g., red and green) 🔴🟢 are attached to the proteins being studied. If the yellow colour 🟡 (i.e., a combination of red and green) appears in the fluorescence microscope image, it means that the objects are in close proximity (i.e., colocalisation). The degree of colocalisation and its changes can then be accurately described using advanced tools such as Kymolyzer (see previous post). 😉

#iemcas #didyouknow #science #research
Vedle výzkumu se v ÚEM AV ČR věnujeme také vývoji vlastních inovativních nástrojů 👨‍💻, které usnadňují a zefektivňují práci vědců a vědkyň. Jedním z nich je 👉 Kymolyzer – open-source software pro automatickou analýzu časosběrných mikroskopických dat, vyvinutý Oddělením funkčního uspořádání biomembrán.

Nástroj dokáže automaticky:

👉 identifikovat objekty ve videích z mikroskopu,
👉 sledovat jejich pohyb (směr, rychlost),
👉 měřit délku výskytu,
👉 analyzovat kolokalizaci ve dvou fluorescenčních kanálech.

Je ideální pro výzkumníky pracující se živými buňkami 🧫, kteří chtějí získat přesná data bez nutnosti manuálního vyhodnocování.

Nástroj vznikl za podpory národní infrastruktury Czech-BioImaging 🔬 a je volně dostupný pod licencí CC BY-NC na GitHubu. Děkujeme! ❤️

📥 github.com/jakubzahumensky/kymolyzer

🇬🇧

In addition to research, we also develop our own innovative tools 👨‍💻 that facilitate and streamline the work of scientists. One such tool is 👉 Kymolyzer, open-source software for automatic analysis of time-lapse microscopic data, developed by the Department of Functional Organisation of Biomembranes.

The tool can automatically:

👉 Identify objects in microscope videos.
👉 Track their movement (direction, speed).
👉 Measure the duration of their occurrence.
👉 Analyse colocalisation in two fluorescence channels.

It is ideal for researchers working with live cells 🧫 who want to obtain accurate data without the need for manual evaluation.

The tool was developed with the support of the Czech-BioImaging national infrastructure 🔬 and is freely available under a CC BY-NC licence on GitHub. Thank you! ❤️

📥 github.com/jakubzahumensky/kymolyzer

#iemcas #avcr #newtool #microscopyanalysis #livecellimaging #biomedicine #science #research
Již zítra proběhne první panelová diskuze v r Již zítra proběhne první panelová diskuze v rámci @colours_cz 2025, kterou bude moderovat popularizátorka a vědecká novinářka 🎤 @pavlahubalkova. Debata s 👩‍🔬 Kateřinou Hoňkovou a 👨‍🔬 Ondřejem Kořistkou Vás zavede do fascinujícího světa astronomie 🪐 a jaderné fyziky, kde se prolínají největší záhady vesmíru 🚀 i základní stavební kameny hmoty. Společně představí klíčové principy a nejnovější objevy, které mění náš pohled na svět kolem nás.

Kateřina se pohybuje mezi dvěma na první pohled neslučitelnými světy – astronomií a toxikologií. 🧪 V ÚEM AV ČR působí na Oddělení toxikologie a molekulární epidemiologie, kde pomocí analýzy DNA zkoumá 🧬, jak znečištěné ovzduší ovlivňuje lidské zdraví. Její mezioborový přístup propojuje poznání vesmíru s porozuměním procesům, které ovlivňují život na Zemi. 🌍

👀 Více informací naleznete na webu Colours of Ostrava:

www.colours.cz/ucinkujici/zarovky-rozzarena-astronomie-i-jaderna-fyzika

🇬🇧

Tomorrow, the first panel discussion as part of @colours_cz 2025 will take place, moderated by populariser and science journalist 🎤 @pavlahubalkova. The debate with 👩‍🔬 Kateřina Hoňková and 👨‍🔬 Ondřej Kořistka will take you into the fascinating world of astronomy 🪐 and nuclear physics, where the greatest mysteries of the universe 🚀 and the basic building blocks of matter intertwine. Together, they will present the key principles and latest discoveries changing our view of the world around us.

Kateřina moves between two seemingly incompatible worlds – astronomy and toxicology. 🧪 At the IEM CAS, she works in the Department of Toxicology and Molecular Epidemiology, where she uses DNA analysis 🧬 to investigate how air pollution affects human health. Her interdisciplinary approach combines knowledge of the universe with understanding the processes that affect life on Earth. 🌍

👀 More information can be found on the official website:

www.colours.cz/en/ucinkujici/zarovky-rozzarena-astronomie-i-jaderna-fyzika

#iemcas #avcr #popularisationofscience #science #research
😎 Léto je pro mnohé časem volnosti, cestová 😎 Léto je pro mnohé časem volnosti, cestování a spontánních rozhodnutí. Není divu, že právě během prázdnin přibývá lidí, kteří se rozhodnou ozdobit své tělo tetováním 🖍️– jako vzpomínku na dobrodružství, symbol nové etapy nebo prostě z touhy po změně. Jenže, co se zdá jako nevinný obrázek pod kůží, může mít i odvrácenou stranu. 

Přestože moderní tetovací techniky působí bezpečně a salony dbají na hygienu, stále častěji se objevují otázky týkající se dlouhodobých zdravotních rizik. Studie dánských vědců z @syddansk_universitet přináší znepokojivé souvislosti mezi tetováním a zvýšeným rizikem vzniku nádorových onemocnění.❗Výzkumníci analyzovali data od více než dvou tisíc dánských dvojčat 👥 a zjistili, že tetování – zejména při větším rozsahu motivu – může být spojeno s vyšším výskytem rakoviny kůže a lymfomů.

Co přesně studie odhalila a jaké látky jsou v inkoustech nejproblematičtější? O komentář jsme požádali toxikologa 👨‍🔬 Pavla Rössnera, vedoucího Oddělení toxikologie a molekulární epidemiologie, který se tématu věnuje v aktuálním čísle časopisu 👉 A / Magazín.

👀 pdf.avcr.cz/A/2025-02/#page=14

🇬🇧

For many people, 😎 summer is a time of freedom, travel and spontaneous decisions. It is no surprise that during the holidays, more and more people decide to decorate their bodies with tattoos 🖍️– as a reminder of an adventure, a symbol of a new phase in their lives or simply out of a desire for change. But what seems like an innocent image under the skin can also have a dark side. Although modern tattooing techniques appear safe and salons pay attention to hygiene, questions about long-term health risks are increasingly being raised. 

A study by Danish researchers from the @syddansk_universitet 🇩🇰 reveals a worrying link between tattoos and an increased risk of cancer.❗The researchers analysed data from more than two thousand Danish twins 👥 and found that tattoos, especially large ones, may be associated with a higher incidence of skin cancer and lymphoma. 

🔗 pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/398194

💡 What exactly did the study reveal? Read the comment by 👨‍🔬 Pavel Rössner, head of the Dept. of Toxicology and Molecular Epidemiology on our FB/LI.
Follow on Instagram

O nás

  • Základní informace
  • Vedení a struktura
  • Výroční zprávy
  • HR Award
  • Hodnotící zpráva 2015–2019 (PDF)
  • Zobrazit cookies lištu
  • Prohlášení o přístupnosti

Výzkum

  • Servisní skupina Mikroskopie
  • Publikace
  • Projekty
  • Patenty
  • Výzkumné infrastruktury
  • Komercializace výstupů VaV

Výzkumná oddělení a centra

  • Buněčná neurofyziologie
  • Funkční uspořádání biomembrán
  • Molekulární biologie nádorů
  • Neurochemie
  • Neurofyziologie sluchu

  • Plasticita buněčného jádra
  • Regenerace nervové tkáně
  • Tkáňové inženýrství
  • Toxikologie a molekulární epidemiologie
  • Vývojová biologie
  • Centrum rekonstrukčních neurověd

Vývoj webu byl financován z prostředků:

Logo Evropská unie, Evropské strukturální a investiční fondy, Operační program Výzkum, vývoj a vzdělávání Logo Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy

Jsme hrdým držitelem ocenění:

Logo HR Excellence in research Ethnic Friendly Zaměstnavatel

© 2023 Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.

Vytvořeno v digihive Odkaz se otevře v novém okně – webdesign Odkaz se otevře v novém okně a PPC kampaně Odkaz se otevře v novém okně

Při tvorbě webu jsme postupovali podle WCAG 2.2 Odkaz se otevře v novém okně

Přístupnost zajišťuje ACTUM digital Odkaz se otevře v novém okně

Nastavit připomenutí