Skip to the main content
Logo Ústav experimentální medicíny - go to homepage
  • About Us
    • Basic Information
    • Management and Structure
    • Mandatory Disclosures
      • Procurement
      • Annual Reports
      • Disclosure of Information by Law
    • Institutional Policy
      • Code of Conduct
      • Gender Policy
      • HR Excellence in Research
      • Privacy Policy
      • Research Data Policy
      • Internal Whistleblowing System
  • News and Events
    • News
    • Events
  • Research
    • Research Departments and Centres
    • Microscopy Service Unit
    • Research Projects
    • Research Infrastructures
    • Publications
    • Patents
  • Study and Careers
  • Public and Media
    • Media
    • Popularisation of Science
  • Contacts
  • CZ
  • EN
Log In
  • CZ
  • EN
Home Vladimír Holáň
Vladimír Holáň

Prof. Vladimír Holáň, DrSc.

Telefonní číslo +420 241 063 226
Mailová adresa vladimir.holan@iem.cas.cz
Skip the navigation
  • Department

Department

Department of Toxicology and Molecular Epidemiology

Research Department

Head of the Department

Pavel Rössner


Footer

Stay in touch with us.

To get the latest information from the IEM CAS, please follow us on our social media.

  • +420 241 062 230
  • iem@iem.cas.cz
  • Vídeňská 1083, 142 00, Prague 4 Odkaz se otevře v novém okně
Facebook Instagram Youtube Linkedin
Skip Instagram section
Follow Us on Instagram

iemcas

🇨🇿 Biomedicínským výzkumem k efektivní diagnostice a léčbě
🇬🇧 Biomedical research towards effective diagnosis and treatment

💉 Chemoterapie pomáhá prodlužovat život pac 💉 Chemoterapie pomáhá prodlužovat život pacientům s rakovinou tlustého střeva a konečníku, ale často s sebou nese závažné vedlejší účinky. Ty mohou výrazně zhoršit kvalitu života, někdy si vyžádají přerušení léčby a v krajních případech mohou být i život ohrožující. Proč ale někteří pacienti reagují na léky tak dramaticky, zatímco jiní je snášejí bez větších problémů? 🤔
 
Na tuto otázku hledá odpověď nová studie publikovaná v prestižním časopise 📑 British Journal of Pharmacology (IF 7,7). V krátké době jde již o druhou mezinárodní publikaci, na které se podílela také genetička 👩‍🔬 Veronika Vymetálková z ÚEM AV ČR. Cílem studie bylo najít genetické varianty, které by mohly pomoci předpovědět, u koho je vyšší riziko závažných nežádoucích účinků.
 
Výzkumný tým analyzoval genetickou informaci 163 pacientů, kteří během chemoterapie prodělali závažné vedlejší účinky (stupeň 3–4 dle mezinárodní škály), a porovnal je s genetickými daty 52 pacientů bez těchto komplikací. Pomocí metody celogenomového sekvenování objevil několik známých i dosud nepopsaných genetických změn, které by mohly souviset s toxicitou léčby. 🔬 

🔍 Jedním z hlavních nálezů byla nová potenciálně riziková varianta v genu DPYD, který hraje významnou roli v metabolismu léčiv. Vědci a vědkyně také identifikovali 30 dalších vzácných mutací ve 14 genech, které by mohly ovlivňovat citlivost na chemoterapii, například ve vztahu k poškození nervů, kůže nebo srdce. ❤️ Zároveň objevili tři dosud nepopsané geny 🧬– ALDH9A1, FAM83A a EPX, které identifikovali jako možné kandidáty spojené s toxicitou léčby. 💡 Zajímavostí je také nález tzv. digenní dědičnosti, kdy kombinace variant ve dvou různých genech může společně zvyšovat riziko vedlejších účinků. Tyto objevy otevírají dveře k přesnějšímu a bezpečnějšímu přístupu k onkologické léčbě. 🏥
 
💬 „Rádi bychom přispěli k tomu, aby se genetické testování postupně stalo běžnou součástí plánování léčby. Informace o přítomnosti určitých genetických variant by v budoucnu mohly lékařům pomoci lépe přizpůsobit dávkování léčby, nebo případně zvolit vhodnější typ léčby,“ vysvětluje 👩‍🔬 Veronika Vymetálková, spoluautorka studie. 

🇬🇧

English version 👉 FB/LI
🚗 Až budete stát v kolonách cestou z dovolen 🚗 Až budete stát v kolonách cestou z dovolené nebo do práce, pusťte si tuhle píseň a zkuste se na chvíli zamyslet: 🤔 Děláme opravdu dost pro ochranu ovzduší a životního prostředí? 🌍

🎶 Skladba PAREMPI Air Quality Anthem vznikla přímo v terénu během měřících kampaní ve Finsku. 🇫🇮 Za vznikem písně stojí výzkumníci 👨‍🔬 Petteri Marjanen a Hannu Kuutti z @tampereuni a @vttfinland, kteří využili reálné zvuky motorů a čerpadel. Autorem hudby i zpěvákem je 🎙️ Petteri Marjanen. Výsledkem je profesionální skladba (lyrický deník) kombinující prvky folku a popu s výrazným sdělením. Zachycuje každodenní realitu vědců v terénu, jejich osobní motivaci a naději na pozitivní změnu.

▶️ Poslechněte si píseň na YouTube:
bit.ly/4lMFxwp

🇬🇧

🚗 When you're stuck in traffic returning from vacation or on your way to/from work, play this song and think about it for a moment: 🤔 Are we really doing enough to protect the air and the environment? 🌍

🎶 The PAREMPI Air Quality Anthem was created during measurement campaigns in Finland. 🇫🇮 The song was written by researchers 👨‍🔬 Petteri Marjanen and Hannu Kuutti from @tampereuni and @vttfinland, who used authentic sounds of engines and pumps. The author of the music and singer is 🎙️ Petteri Marjanen. The result is a professional track combining elements of folk and pop with a powerful message. It captures the lyrical diary of the everyday reality of the scientists in this campaign, their personal motivation, and their hope for positive change.

▶️Listen to the song on YouTube: 
bit.ly/4lMFxwp

#iemcas #parempi #project #airpollution #research #science
💡 Věděli jste, že…? Kolokalizace je pojem 💡 Věděli jste, že…?

Kolokalizace je pojem používaný především v mikroskopii a buněčné biologii. 🔬 Označuje situaci, kdy se dva (nebo více) fluorescenčně značené objekty v buňce nacházejí v těsné blízkosti – a jejich signály se tedy prostorově překrývají.

To může naznačovat, že:

👉 dvě molekuly (např. bílkoviny) spolu interagují,
👉 jsou součástí stejné buněčné struktury (např. organely),
👉 nebo že probíhá určitý biologický proces na konkrétním místě.

Jak se kolokalizace sleduje?

Pomocí molekulárně-biologických nebo chemických metod se k sledovaným proteinům připojí značky různých barev (např. červená a zelená). 🔴🟢 Pokud se následně na snímku z fluorescenčního mikroskopu objeví žlutá barva 🟡 (tedy kombinace červené a zelené), znamená to, že objekty se nacházejí v těsné blízkosti (tj. kolokalizace). Míru kolokalizace a její změny je následně možné přesně popsat pomocí pokročilých nástrojů, jako je například Kymolyzer (viz předchozí příspěvek). 😉

🇬🇧

💡 Did you know that…?

Colocalisation is a term used primarily in microscopy and cell biology. 🔬 It refers to a situation where two (or more) fluorescently labelled objects are located in close proximity to each other, and their signals therefore overlap spatially.

What does this mean?

👉 That two molecules (e.g. proteins) interact with each other.
👉 They are part of the same cell structure (e.g. organelles).
👉 That a certain biological process is taking place at a specific location.

How is colocalisation detected?

Using molecular biology or chemical methods, different colored dyes (e.g., red and green) 🔴🟢 are attached to the proteins being studied. If the yellow colour 🟡 (i.e., a combination of red and green) appears in the fluorescence microscope image, it means that the objects are in close proximity (i.e., colocalisation). The degree of colocalisation and its changes can then be accurately described using advanced tools such as Kymolyzer (see previous post). 😉

#iemcas #didyouknow #science #research
Vedle výzkumu se v ÚEM AV ČR věnujeme také vývoji vlastních inovativních nástrojů 👨‍💻, které usnadňují a zefektivňují práci vědců a vědkyň. Jedním z nich je 👉 Kymolyzer – open-source software pro automatickou analýzu časosběrných mikroskopických dat, vyvinutý Oddělením funkčního uspořádání biomembrán.

Nástroj dokáže automaticky:

👉 identifikovat objekty ve videích z mikroskopu,
👉 sledovat jejich pohyb (směr, rychlost),
👉 měřit délku výskytu,
👉 analyzovat kolokalizaci ve dvou fluorescenčních kanálech.

Je ideální pro výzkumníky pracující se živými buňkami 🧫, kteří chtějí získat přesná data bez nutnosti manuálního vyhodnocování.

Nástroj vznikl za podpory národní infrastruktury Czech-BioImaging 🔬 a je volně dostupný pod licencí CC BY-NC na GitHubu. Děkujeme! ❤️

📥 github.com/jakubzahumensky/kymolyzer

🇬🇧

In addition to research, we also develop our own innovative tools 👨‍💻 that facilitate and streamline the work of scientists. One such tool is 👉 Kymolyzer, open-source software for automatic analysis of time-lapse microscopic data, developed by the Department of Functional Organisation of Biomembranes.

The tool can automatically:

👉 Identify objects in microscope videos.
👉 Track their movement (direction, speed).
👉 Measure the duration of their occurrence.
👉 Analyse colocalisation in two fluorescence channels.

It is ideal for researchers working with live cells 🧫 who want to obtain accurate data without the need for manual evaluation.

The tool was developed with the support of the Czech-BioImaging national infrastructure 🔬 and is freely available under a CC BY-NC licence on GitHub. Thank you! ❤️

📥 github.com/jakubzahumensky/kymolyzer

#iemcas #avcr #newtool #microscopyanalysis #livecellimaging #biomedicine #science #research
Follow on Instagram

About Us

  • Basic Information
  • Management and Structure
  • Annual Reports
  • HR Excellence in Research
  • Evaluation Report 2015–2019 (PDF)
  • International Mobility

Research

  • Microscopy Service Unit
  • Publications
  • Patents
  • Research Projects
  • Research Infrastructures
  • Commercialisation of R&D Outputs

Research Departments and Centres

  • Auditory Neuroscience
  • Cell Nucleus Plasticity
  • Cellular Neurophysiology
  • Developmental Biology
  • Functional Organization of Biomembranes

  • Neurochemistry
  • Neuroregeneration
  • Molecular Biology of Cancer
  • Tissue Engineering
  • Toxicology and Molecular Epidemiology
  • Centre for Reconstructive Neuroscience

This web development was funded by:

Logo of European Union, European Structural and Investment Funds, Operational Programme Research, Developlent and Education Logo of Ministry of Education, Youth and Sports

We are a proud holder of the awards:

Logo HR Excellence in research Ethnic Friendly Employer

EN © 2023 Institute of Experimental Medicine of the CAS

Created by digihive Odkaz se otevře v novém okně – webdesign Odkaz se otevře v novém okně a PPC kampaně Odkaz se otevře v novém okně

The website was developed in accordance with WCAG 2.2 Odkaz se otevře v novém okně

Accessibility is supervised by ACTUM digital Odkaz se otevře v novém okně

Set Reminder